Предлагается аналитический метод расчета показателей надежности гибридной навигационной системы. Предлагаемый метод основан на фундаментальной матрице решений к системе уравнений Колмогорова и позволяет получить математическое выражение для расчета коэффициента готовности системы и других показателей надежности. Также представленный подход позволяет находить показатели надежности для случаев резкого изменения интенсивности переходов под действием внешних воздействий. Аналитический метод может быть использован для исследования переходных режимов работы гибридной навигационной системы.