В статье рассматривается задача формализованного представления и согласования разнородных данных в распределенной системе комплексного мониторинга подводной среды. Актуальность работы связана с необходимостью совместного использования сенсорных измерений, визуальных данных, диагностических признаков и сведений о контексте наблюдения при оценке состояния акватории. Предложена информационная модель, включающая направления мониторинга параметров водной среды, гидробионтов и подводной инфраструктуры. Для унифицированного описания результатов наблюдения введена типовая запись, содержащая значение или признак, время получения, пространственную или объектную привязку, источник данных и показатель достоверности. Рассмотрен порядок формирования множеств записей, признаковых описаний направлений, набора данных расчетной итерации и обобщенного описания состояния акватории. Разработана процессная информационная модель, отражающая последовательность преобразования данных от задания программы мониторинга и сбора наблюдений до аналитической обработки, представления результата оператору и изменения режима наблюдения. Показано применение модели на примере совместного анализа температуры воды и активности гидробионтов в аквакультурной системе. Предложенный подход может использоваться при проектировании систем подводного мониторинга различного состава и масштаба