Научно-техническая статья посвящена актуальной проблеме поддержки принятия решений по управлению информационной безопасностью (ИБ) субъектов критической информационной инфраструктуры (КИИ) в контексте инфраструктурного деструктивизма. Предложена методология поддержки процессов проактивного управления ИБ субъекта КИИ как сложной организационной системы с динамически изменяющейся структурой. Описаны выполненные для ее реализации шаги. Произведен краткий обзор моделей и методов, связанных с выявлением и идентификацией источников деструктивных воздействий инфраструктурного генеза (ДВ ИГ), а также с моделированием состояний субъекта КИИ при ДВ ИГ, реализованных в рамках предложенной методологии. Осуществлено экспериментальное исследование частной задачи по выбору стратегий функционального развития субъекта КИИ при ДВ ИГ лицом, принимающим решение.