Излагаются теоретические и прикладные аспекты компьютерного моделирования с учетом современных методов построения информационно измерительных и управляющих систем (ИИиУС) летательных аппаратов (ЛА) при их эксплуатации. Объекты ЛА и ИИиУС являются высокотехнологическими и сложными техническими системами (СТС), требующими комбинированных подходов к их оценке. Показаны пути формирования основных блоков информационных моделей для получения основных показателей надежности и безопасности ЛА. Приводятся формулы к использованию адекватных процессам информационных технологий и методов оценки технического уровня создаваемых образцов как одноуровневых, так и многоуровневых иерархических систем в сочетании с известными методиками, действующими алгоритмами и программным обеспечением, являющиеся более полными по информативности с вероятностными характеристиками. Теоретические аспекты в работе и формулировки подкреплены вычислительным экспериментом, в ходе которого осуществлялась доставка груза ЛА в заданную область. Результаты работы могут быть полезными разработчикам беспилотных авиационных систем и специалистам в сфере проектирования объектов СТС при прогнозировании их технического состояния с оценкой функциональной безопасности и обеспечения желаемой эффективности.