В любой организационной системе присутствует множество рисков и характеризующих их элементов. Однако подавляющее большинство исследований, посвященных решению задач управления рисками, в частности его оценке, в сложных организационных системах, предлагают работать с рисками изолировано, без учета их взаимного влияния и взаимосвязи их компонентов, а также прибегают к суммированию оценок локальных рисков. В то же время на практике оценка риска системы без учета структуры его компонентов может привести к ошибочной оценке риска в целом и, как следствие, к применению неправильного управляющего воздействия. В связи с этим существует потребность в комплексном подходе к оценке риска организационной системы на основании его структуры. Когда речь идет о взаимосвязях рисков, наиболее перспективным для данной задачи является механизм комплексного оценивания, правила построения которого позволяют манипулировать структурой дерева, учитывая тем самым влияние элементов системы друг на друга и на интегральный риск. Однако стоит отметить, что структуры риска редко представляют собой бинарные деревья, а значит, что при использовании данного механизма могут возникнуть трудности при обосновании выбора пары компонентов для агрегации. В данной работе предлагается обобщенная модификация классического механизма комплексного оценивания для формализации процедуры перехода от структуры декомпозиции риска к бинарному дереву.