Работа посвящена проблеме учета структурных эффектов при управлении рисками организационных систем. Большинство управленческих методологий не учитывают, что компоненты организационных систем находятся в сложной взаимосвязи, что также справедливо и для ассоциированных с ними рисков. В настоящей работе рассматривается одна из возможных постановок задач минимизации риска, учитывающая взаимовлияние элементов организационной системы с древовидной структурой.