В работе предлагается трехуровневая модель управления рисками, включающая риск-факторы, зависящие от них локальные риски и интегральный риск как агрегат локальных. Исследование направлено на поиск общего подхода к оценке и управлению рисками в сложных системах в условиях взаимного влияния риск-факторов и зависимости локальных рисков друг от друга. Для моделирования взаимного влияния риск-факторов использован аппарат взвешенных ориентированных графов. Для агрегирования значений локальных рисков в интегральный риск применен метод комплексной оценки.