Рассматривается применение методов интеллектуального управления (ИУ) для повышения безопасности и эффективности управления морскими подвижными объектами (МПО) на базе единого подхода к построению и применению интегрированного комплекса систем навигации, управления и обучения операторов с использованием общей подсистемы интеллектуальной поддержки принятия решений (ИСППР). Определены основные принципы построения, структура и задачи комплекса и ИСППР, проанализированы особенности создания и применения общего алгоритмического и программного обеспечения в ИСППР, используемого для автоматической генерации и проверки гипотез, классификации моделей, динамического выбора методов, алгоритмов и сценариев управления и виртульного представления информации оператору управления МПО. Рассмотрено построение прототипа комплекса, реализуемого в виде распределенной микропроцессорной системы управления, приведены результаты имитационного моделирования работы основных алгоритмов управления одним классом МПО.