Одной из типовых задач управления в социально-экономических системах является задача распределения ограниченных ресурсов для обеспечения эффективного функционирования и развития системы. В данной работе предлагается комплексный подход к решению данной задачи, сочетающий в себе методы теоретико-игрового и когнитивного моделирования, комплексного оценивания и многокритериальной экспертизы. Подобный подход позволяет реализовать принципы программно-целевого управления социально-экономическими объектами, широко внедряемый сейчас в практику государственного управления в нашей стране, призванный обеспечить эффективное развитие как всей страны в целом, так и отдельных ее субъектов.