Предложен подход к управлению биотехническими системами, который заключается в использовании интеллектуальных информационных технологий в системе их управления. Рассмотрен вариант построения системы управления, в качестве одного из элементов которой выступает искусственная нейронная сеть. Для обучения искусственных нейронных сетей в работе использован эволюционный алгоритм. Проведена оптимизация эволюционного алгоритма обучения искусственных нейронных с использованием механизма «изоляции». Разработан программно-аппаратный комплекс моделирования, идентификации и управления биотехнологической системой. Серией проведенных вычислительных экспериментов показана его работоспособность.