Рассмотрены актуальность, проблемы, цели и задачи цифровой трансформации систем управления интеллектуальной собственностью (ИС). Предложена формализованная методология построения электронного (цифрового) органа управления ИС, модели, методы и алгоритмы, обеспечивающие последовательное, взаимосвязанное решение задач формализации предметной области системы управления ИС и требований пользователей, построения распределенной структуры системы управления ИС, формирования и развития цифрового информационного фонда интеллектуальной собственности ИС (ЦИФИС), оптимизации структур баз данных патентной и научнотехнической информации, управления качеством и информационной безопасностью данных ЦИФИС. Комплексное решение данных задач позволяет разработать ролевую организационную структуру цифрового органа управления ИС. Разработанная методология использовалась при решении задач цифровой трансформации системы управления международной патентной организации