Исследование структурных изменений в экономике региона является одной из приоритетных целей социально-экономического развития любого региона в условиях нестабильной внешней среды. Для выявления влияния особенностей структурной трансформации на уровень развития региона необходимо провести оценку структурных сдвигов и структурных различий, в частности, на основе измерения критериев отраслевой сбалансированности. Одной из задач исследования являлась разработка концепции сбалансированного развития региона. Авторами в рамках данной концепции при исследовании территории предложено использовать три критерия сбалансированности: отраслевая, региональная сбалансированность и сбалансированность, ориентированная на стратегическое развитие. В статье авторы основное внимание уделяют измерению отраслевой сбалансированности конкретного региона. В статье проведена структуризация частных показателей, используемых для измерения структурной динамики в регионе и анализа отраслевой сбалансированности, определена масса структурного сдвига в двух аспектах: валовая добавленная стоимость и инвестиции. Выявлено, каким образом изменились пропорции отраслевой структуры и насколько сбалансированы были эти изменения в динамике. Предложенная система показателей апробирована при исследовании уровня сбалансированности развития на примере одного из регионов РФ – Республика Бурятия. Проведенное исследование позволило выявить отраслевые особенности развития региона и показало, что для региона характерно несбалансированное развитие в течение исследуемого ретроспективного периода. Наибольшие значения массы структурного сдвига для Республики Бурятия по валовой добавленной стоимости характерны для деятельности по операциям с недвижимым имуществом и экономической деятельности по государственному управлению, наименьшие значения для обрабатывающей промышленности и деятельности по транспортировке и хранению. Исследование структуры валовой добавленной стоимости показало существенно сокращение уровня концентрации отраслей обрабатывающего производства в рассматриваемом регионе.