Работа продолжает серию публикаций материалов исследований авторов в области развития подхода к динамическому планированию и управлению обобщенным вычислительным экспериментом на основе применения методов визуализации и визуальной аналитики. Обобщенный вычислительный эксперимент предполагает многократное решение задачи численного моделирования при различных наборах значений определяющих параметров модели, что позволяет получить решение сразу для некоторого класса задач математического моделирования, заданного в многомерном пространстве параметров. В работе рассматривается расширение существующего авторского подхода к построению визуальных карт обобщенного вычислительного эксперимента, основанное на применении метафор визуализации, способных отображать не только отдельные образы, но и их взаимосвязи. Предлагается метод построения визуальных карт обобщенного вычислительного эксперимента, ориентированных на визуализацию связей между одиночными вычислительными экспериментами в трехмерном пространстве. В основе метода лежит механизм формализации связей между одиночными вычислительными экспериментами, а также понятие метафоры визуализации графовой модели, задающей прообраз визуальной карты. Приводится описание программной системы построения и анализа трехмерных визуальных карт обобщенного вычислительного эксперимента, и рассматриваются примеры ее применения при оценке точности численных моделей программной платформы OpenFOAM для трехмерной задачи невязкого обтекания конуса.