Поставлена задача установления методологических требований, определяющих механизм защиты информации, передаваемой в системах с гибридным интеллектом. На примере модели взаимодействия функциональных модулей космического комплекса как социо-киберфизической системы предложено оценивать динамику его технического состояния. Для организации механизмов гибридного интеллекта сложной человеко-машинной системы предложены принципы формирования требований к обеспечению устойчивости работы данного комплекса. Обобщение возможностей использования методологии формирования базы знаний для оценки технического состояния космического комплекса определило основные требования к алгоритму защиты информации, передаваемой его функциональными модулями.