В статье рассматривается проблема ресурсной поддержки научно-исследовательских центров. Представлены результаты анализа области исследования, выявлены позитивные и негативные факторы, влияющие на развитие научно-исследовательской работы. В качестве компонент информационной модели выделены основные структуры, участвующие в выделении имущества, денежных средств, выдачи заказов и грантов научным организациям. Разработана и исследована структура сценарной имитационной модели данной предметной области и получены базовые сценарии поведения целевых факторов при различных условиях. Основной акцент в статье делается на преимущества сценарного подхода к исследованию сложных систем и выработке управленческих решений