66804

Автор(ы): 

Автор(ов): 

1

Параметры публикации

Тип публикации: 

Тезисы доклада

Название: 

Приближенные методы анализа в протеомике

Электронная публикация: 

Да

ISBN/ISSN: 

978-5-317-06593-5

Наименование конференции: 

  • Международный молодежный научный форум «ЛОМОНОСОВ-2021»

Наименование источника: 

  • Материалы Международного молодежного научного форума «ЛОМОНОСОВ-2021»

Город: 

  • Москва

Издательство: 

  • МАКС Пресс

Год издания: 

2021

Страницы: 

https://lomonosov-msu.ru/archive/Lomonosov_2021/data/section_34_22384.htm
Аннотация
В настоящее время протеомика и анализ генома являются чрезвычайно важными и актуальными направлениями исследований. Так, например, недавно был расшифрован геном утконоса [1]. Подобные научные работы помогают понять, как зародилась жизнь, ее эволюцию, а также найти методы борьбы с заболеваниями. Однако большинство алгоритмов идентификации белков являются достаточно трудоемкими и занимают длительное время расчетов на суперкомпьютерах. Подробный обзор существующих подходов и алгоритмов приведен в [2]. В данной работе предложены приближенные методы качественного и количественного анализа белков на основе данных спектрометрии. В отличие от широко применяемых методов, таких как [3] и [4], приближенные алгоритмы дают неточные решения, но работают гораздо быстрее. Предложенные методы позволяют получить оценочные данные об исследуемом образце, и на их основе выстроить дальнейшую более обстоятельную работу по изучению. Для удаления шумов на спектрограммах применен метод, аналогичный методу, применяемой в вычислительной фотографии [5]. После удаления шумов необходимо идентифицировать пики. Предлагается сведение данной задачи к задаче о рюкзаке. Предложен подход для приближенного восстановления исходной последовательности на основе данных, полученных в процессе идентификации пиков спектрограммы.

Библиографическая ссылка: 

Гришин Е.М. Приближенные методы анализа в протеомике / Материалы Международного молодежного научного форума «ЛОМОНОСОВ-2021». М.: МАКС Пресс, 2021. С. https://lomonosov-msu.ru/archive/Lomonosov_2021/data/section_34_22384.htm.