В работе изложена методология построения и применения сценарных систем, которая позволяет проводить формализованные исследования социально-экономических процессов. В качестве исходных концепций, основные принципы которых систематически проводятся в работе, служат методологии системного и сценарного анализа сложных систем. Описаны этапы проектирования сценарной системы на всех стадиях ее создания: от формирования исходных целевых установок и квазиинформационных гипотез, до реализации и интерпретации полученных сценариев поведения изучаемых объектов исследования. Предложена концепция реализации синерго-аттрактивного построения сценарной системы на основе выделения экспертнозначимых разбиений, при этом вводятся новые структурные элементы: области описания и управления, которые позволяют эффективно проводить структуризацию экспертных знаний о параметрах и их взаимосвязях в социально-экономических системах (СЭС). В качестве применения рассмотрены результаты сценарного моделирования ряда СЭС, а также представлено описание имитационной модели импульсного анализа СЭС «ИМПАН».