Рассмотрено применение метода анализа среды функционирования (Data Envelopment Analysis, DEA) в приложении к задачам оценки эффективности функционирования региональных инновационных систем Казахстана. Полученные результаты позволяют рассмотреть динамику развития региональных инновационных систем, а также способствуют выработке рекомендаций по эффективному использованию ресурсов при формировании экономической политики регионов. The application of the method of analysis of the environment of functioning (Data Envelopment Analysis, DEA) in the application to the tasks of assessing the effectiveness of the functioning of regional innovation systems of Kazakhstan is considered. The results obtained allow us to consider the dynamics of the development of regional innovation systems, as well as contribute to the development of recommendations for the efficient use of resources in shaping the economic policies of the regions.