В статье проанализировано влияние систем управления на конкурентоспособность, экономическую безопасность медицинских организаций. Рассмотрено внедрение системы Lean Healthcare, сравнивается ее влияние на развитие и экономическую безопасность медицинской организации с воздействием систем управления качеством. Проанализированы формирование цепочек ценностей для пациентов и медицинских организаций, факторы влияния бережливого производства. Изучены меры, спектр качественных инструментов и подход к вопросу о потерях в медицинской организации при внедрении концепции обеспечения экономической безопасности на основе создания цепочек ценностей.