В работе разработана методика по поддержке принятия управленческих решений в отношении учебных программ пилотного вуза. Для учета управления экономикой вуза и оценки достаточности финансового обеспечения деятельности учебных и других программ и использования имущества, вводится показатель маржинальной прибыли: «Маржинальная прибыль 1», покрывающая прямые расходы по учебным программам и НИОКР и другим текущим расходам, и «Маржинальная прибыль 2», дополнительно покрывающая расходы на содержание имущества. Приведены расчеты маржинальной прибыли для пилотного вуза.