Рассмотрены проблемы государственно-частного партнерства при построении транспортно-логистической системы в России. Проанализированы инфраструктурные проекты, финансируемые из Инвестиционного фонда РФ. Указано на необходимость проектирования и строительства транспортно-логистических комплексов как системы.