В работе представлены оценки динамики вариабельности сердечного ритма при работе с линейкой перспективных интерфейсов человек-компьютер. Регистрация вариабельности сердечного ритма осуществлялась по ЭКГ-каналу с дальнейшей детекцией зубца R. На основе данных вариабельности сердечного ритма при освоении электромиографического, дыхательного, нейрокомпьютерного (мозг-компьютер), окулографического интерфейсов, выявлено, что наименьшее влияние на вегетативное обеспечение вариабельности сердечного ритма оказывает окулографический интерфейс. Будучи достаточно точным, простым и эргономичным данный программно-аппаратный комплекс не вызывает у пользователя отрицательных эмоций, связанных с точностью и устойчивостью работы, но при этом и не требует серьёзного изменения, например, в мышечной активности, или же в режиме дыхания. При этом окулографический интерфейс достаточно эргономичен, что бы не вызывать стрессовые реакции у пользователя. Дыхательный интерфейс, являясь простым в реализации и точным в применении, обеспечивает управление изменением паттерна дыхания у пользователя, что сказывается на его вегетативном статусе за счёт эффектов кардио-респираторной синхронизации. Таким образом, даже высокая эргономика дыхательного интерфейса не обеспечивает отсутствие влияния на показатели вегетативного гомеостаза. Нейрокомпьютерный интерфейс, подобно окулографическому, не продемонстрировал (за исключением одного показателя) значимых различий между фоновым состоянием и работой пользователя. Тем не менее, нейрокомпьютерные интерфейсы в своих текущих реализациях существенно уступают в скорости и точности работы окулографическим, при этом обладая значительно худшей эргономикой, вызывая усталость и неприятные ощущений у оператора после длительного использования. Эмоциональная реакция пользователя на ошибочные распознание его команд интерфейсом являются следствием высокой или низкой мотивации, что может приводить и к отсутствию вегетативных реакций при работе с данными программно-аппаратными решениями или их незначительный выраженности. Электромиографический интерфейс так же достаточно выражено влияет на вегетативное управление ВСР в первую очередь видимо за счёт упреждающей регуляции при физической нагрузке, несмотря на то, что в работе интерфейса участвовали только мышцы предплечья.