Рассматривается метод формирования алгоритмов оптимизации нестационарных систем управления, основанный на применении уравнения Гамильтона – Якоби и принципа минимума Понтрягина. Построенные алгоритмы могут использоваться как для оптимизации самих нестационарных объектов, если для этой цели выделены соответствующие параметры, так и для оптимизации всей управляемой системы с помощью соответствующей параметрической настройки регуляторов. Эффективность разработанных алгоритмов продемонстрирована на примере управления подачей антиретровирусных препаратов в организм человека при наличии ВИЧ.