Рассмотрены проблемы организационного управления рисками промышленной безопасности больших транспортных систем (БТС). На основе теории безопасности больших систем, а также теории БТС и опыта разработки крупномасштабных систем промышленной безопасности на транспорте, предложена методология снижения техносферных рисков с помощью прогрессивных интеллектуальных механизмов, обеспечивающих активизацию человеческого фактора, а также интеграцию естественного и искусственного интеллекта при принятии решений в БТС. Такая интеграция достигается за счет сочетания знаний, опыта и интуиции лиц, принимающих решения, с оптимальными процедурами адаптивной идентификации и прогнозирования, обучения и управления, минимизирующими риски промышленной безопасности БТС в условиях динамики и неопределенности.