Кузнецов Е. Н. (ИПУ РАН, Лаборатория 25). Публикации

Библиографическая ссылкаГод

Брошюры

1Кузнецов Е.Н., Спиридонова Т.А. Подготовка и оформление предметно-аналитической справки (курсовой работы) по эконометрике. М.: ВАВТ, 2007. – 80 с.2007

Статьи в журналах/сборниках из перечня Web of Science/Scopus

2Anashkina A.A., Kravatsky Y.V., Кузнецов Е.Н., Makarov A.A., Adzhubei A.A. Meta-server for automatic analysis, scoring and ranking of docking models. // Bioinformatics. 2018. V. 34, i. 2. С. 297–299.2018
3Анашкина А.А., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г., Есипова Н.Г., Батяновский А.В., Урошлев Л.А. Взаимодействия белок-ДНК: статистический анализ межатомных контактов в большой и малой бороздках. // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2017. Том 21, № 8. С. 887-894.2017
4Anashkina A.A., Кузнецов Е.Н., Esipova N.G., Tumanyan V.G. Comprehensive Statistical Analysis of Residues Interaction Specificity at Protein - Protein Interfaces // PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics. 2007. Vol.67, No4. С. 1060-1077.2007
5Анашкина А.А., Кузнецов Е.Н., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Comprehensive Statistical Analysis of Residues Interaction Specificity at Protein - Protein Interfaces // Bioinformatics. 2007. С. 1060-1077.2007

Статьи в журналах/сборниках из перечня ВАК

6Кузнецов Е.Н. Анализ структуры сетевых взаимодействий: контекстно-зависимые меры центральности // Управление большими системами. 2019. вып. 80. С. 57-82.2019
7Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Дорофеюк А.А., Дорофеюк Ю.А., Есипова Н.Г., Спиро А.Г., Туманян В.Г. Кластерный анализ ДНК-белковых пространственных контактов с использованием процедуры Вороного-Делоне // Труды ИСА РАН. 2016. Том 66, вып. 4. С. 85-96.2016
8Анашкина А.А., Кузнецов Е.Н., Батяновский А.В., Гнучев Н.В., Туманян В.Г., Есипова Н.Г. Клаccификация аминокиcлотныx оcтатков на оcнове cpавнительного анализа контактов в cтpуктуpаx комплексов белок–ДНК и cпецифичеcкие взаимодействия ДНК–белок. / Биофизика. М.: Академиздатцентр «Наука» РАН, 2013. том 58, вып.6. С. 975-980.2013
9Брагин А.И., Кузнецов Е.Н. Анализ значений суверенного кредитного рейтинга и его моделирование // Российский внешнеэкономический вестник. 2011. № 12. С. 21-36.2011
10Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г. Специфичность контактов в комплексах белок-ДНК. / Компьютерные исследования и моделирование. Ижевск: АНО Ижевский институт компьютерных исследований, 2009. Том 1, № 3. С. 281-286.2009
11Анашкина А.А., Туманян В.Г., Кузнецов Е.Н., Галкин А.В., Есипова Н.Г. Геометрический анализ ДНК-белковых взаимодействий на основе метода Вороного-Делоне. / Биофизика. М.: Наука, 2008. том.53, №3. С. 402-406.2008

Статьи в журналах/сборниках

12Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Кластер-анализ пространственных контактов аминокислотных остатков белков с нуклеотидами ДНК // Машинное обучение и анализ данных. 2014. Т. 1, № 9. С. 1180-1199.2014

Доклады

13Кузнецов Е.Н. Контекстно-зависимые меры центральности / Труды 13-го Всероссийского совещания по проблемам управления (ВСПУ XIII, Москва, 2019). М.: ИПУ РАН, 2019. С. 1758-1763 https://vspu2019.ipu.ru/proceedings/1758.pdf.2019
14Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Выделение ключевых взаимодействий белок-ДНК методами классификации и оптимальной группировки взаимосвязанных упорядоченных объектов / Труды 9-ой Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD'2016, Москва). М.: ИПУ РАН, 2016. Т. II. С. 404-413.2016
15Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Ключевые взаимодействия белок-ДНК: поиск методами классификации и оптимальной группировки взаимосвязанных упорядоченных объектов / Материалы 9-ой Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD'2016, Москва). М.: ИПУ РАН, 2016. Том II . С. 426-428.2016
16Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Кластер-анализ аминокислотных остатков белков на основе структуры их пространственных кон-тактов с нуклеотидами ДНК / Материалы 8-ой Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD'2015, Москва). М.: ИПУ РАН, 2015. Т. 2. С. 382-385.2015
17Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Кластер-анализ аминокислотных остатков белков на основе структуры их пространственных контактов с элементами нуклеиновых последовательностей. / Труды 8-ой Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD'2015, Москва). М.: ИПУ РАН, 2015. Т. 2. С. 305-317.2015
18Кузнецов Е.Н., Гольдовская М.Д., Анашкина А.А., Поляновский В.О., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Классификация аминокислот на основе расчета пространственных контактов аминокислотных остатков белков с нуклеотидами ДНК / Труды XII Всероссийского совещания по проблемам управления (ВСПУ-2014, Москва). М.: ИПУ РАН, 2014. С. 6496-6512.2014
19Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Киселева Н.Е., Чернявский А.Л. Методы исследования взаимного расположения элементов протяжённых объектов сложной природы. / Материалы конференции «Управление в интеллектуальных, эргатических и организационных системах» (УИнтЭргОС-2013, Таганрог). Ростов н/Д.: Издательство Южного федерального университета (НИИ многопроцессорных вычислительнх систем им.акад. А.В.Каляева ЮФУ), 2013. том 3. С. 184-187.2013
20Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Покровская И.В., Киселева Н.Е. Анализ взаимного расположения элементов протяжённых пространственных объектов сложной природы (на примере ДНК-комплексов). / Материалы 7-й Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD-2013, Москва). М.: ИПУ РАН, 2013. Том 2. С. 38-40.2013
21Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Киселева Н.Е. Моделирование пространственного взаиморасположения элементов сложных протяжённых объектов. / Труды Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD'2011, Москва). М.: ИПУ РАН, 2012. Том 1. С. 293-304.2012
22Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Чернявский А.Л. Моделирование взаимного расположения элементов протяжённых пространственных объектов сложной природы. / Материалы 6-й Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD-2012, Москва). М.: ИПУ РАН, 2012. Том 1. С. 377-380.2012
23Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Чернявский А.Л. Статистическая модель оценки структуры взаиморасположения элементов протяжённых пространственных объектов сложной природы. / Труды 5-й Российской мультиконференции по проблемам управления, конференция «Управление в технических, эргатических, организационных и сетевых системах» (УТЭОСС-2012, Санкт-Петербург). СПб.: ГНЦ РФ ОАО «Концерн «ЦНИИ «Электроприбор», 2012. С. 1030-1034.2012
24Анашкина А.А., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г. Компьютерное моделирование ДНК-белковых взаимодействий. / Труды Международной научно-практической конференции «Теория активных систем» (TAS'2011, Москва). М.: ИПУ РАН, 2011. 2. С. 36-40.2011
25Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Туманян В.Г. Классификация на основе сравнительного анализа. / Труды 5-й Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD-2011, Москва). М.: ИПУ РАН, 2011. 2. С. 258-263.2011
26Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Туманян В.Г., Есипова Н.Г. Метод Вороного-Делоне в задаче компьютерного моделирования ДНК-белковых взаимодействий / Труды 4-й Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD-2010, Москва). -: -, 2010. С. 4.2010
27Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Туманян В.Г., Есипова Н.Г. Статистическое моделирование ДНК-белковых взаимодействий на основе метода Вороного-Делоне / . -: -, 2009. С. 425-433.2009
28Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г. Статистический анализ распределения контактов в белок-белковых комплексах / . М.: ИПУ РАН, 2006. С. 348-355.2006

Тезисы докладов

29Анашкина А.А., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г., Есипова Н.Г. Как бороздки ДНК распознаются белками. / Материалы 5-го съезда биофизиков России (Ростов-на-Дону, 2015). Ростов н/Д.: ЮФУ, 2015. Т. 2. С. 9.2015
30Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г. Native proteins and decoys: subtle structure difference. / Proceedings of the international conference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology. Novosibirsk: BGRS\SB, 2014. С. 22.2014
31Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Cluster analysis of spatial contacts of amino acid residues of proteins with DNA nucleotides / Proceedings of the International Conference IIP-10. Moscow: Torus Press, 2014. С. 177-178.2014
32Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Кластер-анализ пространственных контактов аминокислотных остатков белков с нуклеотидами ДНК / Тезисы докладов 10-й Международной конференции «Интеллектуализация обработки информации» (ИОИ-10, Греция, о. Крит, 2014). М.: Торус Пресс, 2014. С. 176-177 http://mmro.ru/files/2014-iip-10.pdf.2014