Предмет. Существующие в настоящее время подходы к управлению природоохранной деятельностью на уровне регионов недостаточно эффективны. Переход на инновационный формат систем экологического менеджмента в соответствии со стандартом ISO 14001:2015 актуализирует вопросы разработки моделей и методов согласования стратегий природоохранной деятельности отдельных предприятий и организаций со стратегиями развития региональных социо-эколого-экономических систем в целом и открывает ряд возможностей для совершенствования инструментов территориального экологического менеджмента. Цели. Разработка типологии региональных экономических систем субъектов Российской Федерации по объему и специфике производимых негативных экологических эффектов для дальнейшей оптимизации стратегий природоохранной деятельности на уровне регионов. Методология. Основным методом исследования является кластерный анализ, проводимый по иерархическому алгоритму кластеризации методом k-средних. Численная реализация метода была обеспечена применением пакета прикладных программ Statistica. Кластеризация регионов проведена по набору статистических показателей, отражающих размер «экологической платы» за производимый в субъекте Российской Федерации общественно значимый продукт, а также показателей, отражающих интенсивность бытового потребления природных ресурсов населением региона и качество экологического менеджмента жилищно-коммунального комплекса. Информационной базой исследования послужили ежегодные Государственные доклады «О состоянии и об охране окружающей среды в Российской Федерации» за 2010–2014 гг. Результаты. Результаты кластерного анализа свидетельствуют о возможности выделения нескольких характерных типов региональных социоэкономических систем, каждому из которых может быть поставлена в соответствие определенная модель регионального экологического менеджмента, учитывающая специфику негативного воздействия экономики и населения региона на окружающую среду. Для двух основных моделей регионального экологического менеджмента предложены конкретные инструменты стимулирования предприятий и организаций к более ответственному экологическому поведению. Выводы. Предложенные инструменты носят рыночный характер и стимулируют экономику региона к переходу на наилучшие доступные технологии производства, что в результате должно положительно сказаться не только на экологии региона, но и на его экономическом развитии.