В настоящей работе предложен метод сетевого анализа среды функционирования, адаптированный для решения практико-ориентированных задач территориального экологического менеджмента. Проведена оценка комплексной эколого-экономической эффективности регионов России с использованием предложенного метода и альтернативных подходов, выявлены сходства и различия в результатах, обсуждены их причины. Выявлено, что основными достоинствами разработанного подхода являются возможность покомпонентной оценки экономической и экологической эффективности региональной экономической системы, возможность учета при расчете экологической эффективности бытовых нагрузок на окружающую среду, осуществляемых населением, а также простота численной реализации, не требующей привлечения специализированных программных средств и компетенций. Недостатком предложенного подхода является неоднозначность выбора экологически эффективных объектов и формы границы экологической эффективности.