Для обеспечения принятия эффективных решений предлагается концепция институционального объединения и формирования структуры инновационного научно-образовательного и производственного комплекса. Инновационный научно-образовательный и производственный комплекс обеспечит новые возможности для образовательного учреждения, связанные с организацией системы непрерывного образования, а также предоставления коммерческих услуг, выполнение государственного заказа на подготовку специалистов с высшим образованием, целевую подготовку специалистов по заданию малых, средних и крупных предприятий бизнеса, адаптацию образовательных программ к требованиям работодателей, профессиональную переподготовку и повышение квалификации, как по заказу образовательных учреждений различных уровней, так и на заказ производственных предприятий и объектов социального комплекса. Выявленные меры, способствующие коммерциализации и трансферту технологии в таком комплексе. Сформулированы основные принципы обеспечения высокого качества подготовки специалистов на базе комплекса. Ключевые слова: система высшего образования, инновации, комплекс, регион.