В докладе представлены результаты исследования барьеров на пути сотрудничества и кооперации между различными структурными элементами региональных инновационных систем (РИС) Люблинского Воеводства (Польша) и Краснодарского края (Россия). Оценка барьеров проведена методом экспертного опроса. Обработка данных экспертного опроса проведена методами непараметрической статистики. Выделены барьеры, по которым наблюдаются статистически значимые различия в оценках экспертами, представляющих различные элементы РИС. Исследован характер этих различий. Сделаны выводы о состоянии РИС Краснодарского края, проведены межстрановые сопоставления.