Анашкина А. А. (Института молекулярной биологии им. В.А.Энгельгарта РАН). Публикации

Библиографическая ссылкаГод

Статьи в журналах/сборниках из перечня Web of Science/Scopus

1Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Макаров А.А., Полуэктов Ю.М., Дмитриев В.А., Миткевич В.А., Петрушанко И.Ю. A novel approach for predicting protein S-glutathionylation // BMC Bioinformatics. 2020. V. 21 (Suppl 11). С. 282-293.2020
2Михальский А.И., Петров И.В., Цурко В.В., Анашкина А.А., Некрасов А.Н. Application of mutual information estimation for predicting the structural stability of pentapeptides // Russian Journal of Numerical Analysis and Mathematical Modelling. 2020. Т. 35, вып. 5. С. 263–271.2020
3Анашкина А.А., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г., Есипова Н.Г., Батяновский А.В., Урошлев Л.А. Взаимодействия белок-ДНК: статистический анализ межатомных контактов в большой и малой бороздках. // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2017. Том 21, № 8. С. 887-894.2017

Статьи в журналах/сборниках из перечня ВАК

4Михальский А.И., Новосельцева Ж.А., Анашкина А.А., Некрасов А.Н. Вероятностная оценка влияния состава пентапептида на его устойчивость // Автоматика и телемеханика. 2023. № 12. С. 38-48.2023
5Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Дорофеюк А.А., Дорофеюк Ю.А., Есипова Н.Г., Спиро А.Г., Туманян В.Г. Кластерный анализ ДНК-белковых пространственных контактов с использованием процедуры Вороного-Делоне // Труды ИСА РАН. 2016. Том 66, вып. 4. С. 85-96.2016
6Анашкина А.А., Кузнецов Е.Н., Батяновский А.В., Гнучев Н.В., Туманян В.Г., Есипова Н.Г. Клаccификация аминокиcлотныx оcтатков на оcнове cpавнительного анализа контактов в cтpуктуpаx комплексов белок–ДНК и cпецифичеcкие взаимодействия ДНК–белок. / Биофизика. М.: Академиздатцентр «Наука» РАН, 2013. том 58, вып.6. С. 975-980.2013
7Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г. Специфичность контактов в комплексах белок-ДНК. / Компьютерные исследования и моделирование. Ижевск: АНО Ижевский институт компьютерных исследований, 2009. Том 1, № 3. С. 281-286.2009
8Анашкина А.А., Туманян В.Г., Кузнецов Е.Н., Галкин А.В., Есипова Н.Г. Геометрический анализ ДНК-белковых взаимодействий на основе метода Вороного-Делоне. / Биофизика. М.: Наука, 2008. том.53, №3. С. 402-406.2008

Статьи в журналах/сборниках

9Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Кластер-анализ пространственных контактов аминокислотных остатков белков с нуклеотидами ДНК // Машинное обучение и анализ данных. 2014. Т. 1, № 9. С. 1180-1199.2014

Доклады

10Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Выделение ключевых взаимодействий белок-ДНК методами классификации и оптимальной группировки взаимосвязанных упорядоченных объектов / Труды 9-ой Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD'2016, Москва). М.: ИПУ РАН, 2016. Т. II. С. 404-413.2016
11Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Ключевые взаимодействия белок-ДНК: поиск методами классификации и оптимальной группировки взаимосвязанных упорядоченных объектов / Материалы 9-ой Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD'2016, Москва). М.: ИПУ РАН, 2016. Том II . С. 426-428.2016
12Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Кластер-анализ аминокислотных остатков белков на основе структуры их пространственных кон-тактов с нуклеотидами ДНК / Материалы 8-ой Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD'2015, Москва). М.: ИПУ РАН, 2015. Т. 2. С. 382-385.2015
13Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Кластер-анализ аминокислотных остатков белков на основе структуры их пространственных контактов с элементами нуклеиновых последовательностей. / Труды 8-ой Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD'2015, Москва). М.: ИПУ РАН, 2015. Т. 2. С. 305-317.2015
14Кузнецов Е.Н., Гольдовская М.Д., Анашкина А.А., Поляновский В.О., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Классификация аминокислот на основе расчета пространственных контактов аминокислотных остатков белков с нуклеотидами ДНК / Труды XII Всероссийского совещания по проблемам управления (ВСПУ-2014, Москва). М.: ИПУ РАН, 2014. С. 6496-6512.2014
15Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Киселева Н.Е., Чернявский А.Л. Методы исследования взаимного расположения элементов протяжённых объектов сложной природы. / Материалы конференции «Управление в интеллектуальных, эргатических и организационных системах» (УИнтЭргОС-2013, Таганрог). Ростов н/Д.: Издательство Южного федерального университета (НИИ многопроцессорных вычислительнх систем им.акад. А.В.Каляева ЮФУ), 2013. том 3. С. 184-187.2013
16Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Покровская И.В., Киселева Н.Е. Анализ взаимного расположения элементов протяжённых пространственных объектов сложной природы (на примере ДНК-комплексов). / Материалы 7-й Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD-2013, Москва). М.: ИПУ РАН, 2013. Том 2. С. 38-40.2013
17Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Киселева Н.Е. Моделирование пространственного взаиморасположения элементов сложных протяжённых объектов. / Труды Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD'2011, Москва). М.: ИПУ РАН, 2012. Том 1. С. 293-304.2012
18Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Чернявский А.Л. Моделирование взаимного расположения элементов протяжённых пространственных объектов сложной природы. / Материалы 6-й Международной конференции «Управление развитием крупномасштабных систем» (MLSD-2012, Москва). М.: ИПУ РАН, 2012. Том 1. С. 377-380.2012
19Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Чернявский А.Л. Статистическая модель оценки структуры взаиморасположения элементов протяжённых пространственных объектов сложной природы. / Труды 5-й Российской мультиконференции по проблемам управления, конференция «Управление в технических, эргатических, организационных и сетевых системах» (УТЭОСС-2012, Санкт-Петербург). СПб.: ГНЦ РФ ОАО «Концерн «ЦНИИ «Электроприбор», 2012. С. 1030-1034.2012

Тезисы докладов

20Кузнецов Е.Н., Кравацкий Ю.В., Туманян В.Г., Аджубей А.А., Анашкина А.А. Ранжирование и анализ моделей белок-белкового докинга онлайн мета-сервером QASDOM / Тезисы докладов 19-й Всероссийской конференции с международным участием "Математические методы распознавания образов" (Москва, 2019). М.: РАН, 2019. С. 301-302.2019
21Анашкина А.А., Кравацкий Ю.В., Кузнецов Е.Н., Аджубей А.А. QASDOM: мета-сервер для анализа, оценки и ранжирования моделей белок-белкового докинга. / Материалы Международной конференции «Математика. Компьютер. Образование» (Пущино, 2017). Пущино: Пущинский Научный Центр, 2017. С. 243-244 http://www.mce.su/rus/archive/abstracts/mce24/sect220405/doc283297/.2017
22Анашкина А.А., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г., Есипова Н.Г. Как бороздки ДНК распознаются белками. / Материалы 5-го съезда биофизиков России (Ростов-на-Дону, 2015). Ростов н/Д.: ЮФУ, 2015. Т. 2. С. 9.2015
23Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г. Native proteins and decoys: subtle structure difference. / Proceedings of the international conference Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\Systems Biology. Novosibirsk: BGRS\SB, 2014. С. 22.2014
24Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Cluster analysis of spatial contacts of amino acid residues of proteins with DNA nucleotides / Proceedings of the International Conference IIP-10. Moscow: Torus Press, 2014. С. 177-178.2014
25Кузнецов Е.Н., Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Туманян В.Г. Кластер-анализ пространственных контактов аминокислотных остатков белков с нуклеотидами ДНК / Тезисы докладов 10-й Международной конференции «Интеллектуализация обработки информации» (ИОИ-10, Греция, о. Крит, 2014). М.: Торус Пресс, 2014. С. 176-177 http://mmro.ru/files/2014-iip-10.pdf.2014