В настоящее время электронный документооборот набирает свою популярность, его можно встретить не только в отдельно взятых организациях, но и на различного рода взаимодействиях между структурами и организациями (электронное правительство). Последний аспект позволяет с уверенностью говорить о необходимости развития систем обеспечения безопасности электронного документооборота в современных условиях. Основное внимание в статье уделяется рассмотрению основ и принципов построения систем документооборота для небольших и средних организаций. Перечислены задачи защиты системы электронного документооборота и требования к системе, выдвигаемые для обеспечения ее безопасности. На основе комплексного анализа существующих систем и методов защиты выработаны основные направления развития данного рода систем. Предложенные направления развития систем обеспечения безопасности электронного документооборота, при их одновременной реализации, позволят повысить эффективность защиты как самих систем документооборота, так и отдельных хранящихся в них данных. Не останется в стороне и технология блокчейн, в рамках которой может быть реализована всесторонняя защита документов и документооборота, тем самым повышая эффективность работы организации. Интеграция научно-технического прогресса в конечном счёте одной из основных и наиболее приоритетных задач определяет в данной области полную стандартизацию СЭД, определяя позитивную динамику на рынке услуг в целом.