Внедрение инноваций сказывается на показателях эффективности соответствующих отраслей хозяйственной деятельности и экономической системы в целом. Инвестиции в инновационную деятельность могут окупаться за весьма длительные периоды времени. В то же время, системный эффект от внедрения инноваций может существенно зависеть от инвестируемой отрасли. Стихийное развитие отраслей экономики замедляет ее системный рост и таким образом отрицательно влияет на эффективность инвестиций в инновационную деятельность. Для выбора предпочтительных направлений инноваций важно иметь ориентиры касательно ожидаемого эффекта от соответствующих вложений.