Ключевым методологическим аспектом обсуждаемой монографии выступает принцип системности. Авторы развивают логику системного взаимодействия четырех типов субстанций — среды, объекта, процесса и проекта, единство которых они называют тетрадой. Данный принцип системности применяется в работе к различным социально-экономическим системам — от предприятий и их подразделений до мирового хозяйства. При этом авторы выделяют определенную цикличность в развитии экономических систем любого уровня, связанную с чередованием четырех основных фаз, каждая из которых связана с одной из четырех базовых субстанций. В работе также исследуется принцип вложенности экономических систем друг в друга, характеризующий наличие или отсутствие в них фрактальности, самоподобия. Вместе с тем на принятие решений влияет устройство функций полезности агентов различных уровней, агрегирование которых — самостоятельная и весьма сложная задача. Отдельное внимание в работе уделяется «дисменеджменту», то есть принятию решений, основанному на применении управленческих дисфункций. Авторы развивают «анималистское» направление в теории фирмы, пытаясь теоретически осмыслить категорию «душа компании».