Рассмотрены особенности формирования и характеристики патентных баз данных. Приведена классификация патентной информации. Выявлены угрозы информационной безопасности патентной информации и пути ее утечки в патентном ведомстве. Введено формализованное определение механизма защиты патентной базы данных и предложены модели и методы построения оптимальных механизмов защиты структур патентных баз данных патентно-информационного фонда на разных уровнях их представления – концептуальном, логическом и физическом. Полученные результаты использованы при построении системы управления информационной безопасностью Евразийского патентного ведомства