Ухудшение экологической обстановки в мире во многом обусловлено отсутствием системы эффективного управления в сфере природопользования. Существующая система экологического аудита не позволяет объективно оценивать состояние окружающей среды и принимать решения по рациональному природопользованию и управлению крупномасштабными экологическими системами. В данной статье предлагается использовать новый подход к реализации экологического аудита, основанный на технологии виртуальной реальности, синерготехнологии и фрактальном моделировании. Рассмотрены общие понятия о технологии виртуальной реальности и области перспективного использования в управлении крупномасштабными экологическими системами. Обоснована необходимость применения синерготехнологий и фрактального моделирования при реализации экспертно-аналитической системы экологического аудита.