Описаны современные принципы организации и управления прикладными научными исследованиями и развитием компетенций отраслевой авиационной науки, позволяющие создавать опережающий научно-технический задел для разработки перспективной авиационной техники в рамках жестких ресурсных ограничений. Также обозначены нерешенные методологические проблемы, которые необходимо решить для создания эффективной системы управления авиационной наукой.