Современные исследования сложных многокомпонентных систем во многом базируются на проведении численных экспериментов с при- менением компьютерных математических моделей [1]. Теория и практика по- строения подобных моделей сформировали отдельное междисциплинарное на- учное направление, успешно использующее результаты исследований в таких областях знаний, как: численные методы, дискретная математика, системный анализ, теория сложности, методы оптимизации, вычислительная техника и программирование и пр. В настоящей работе рассматриваются основные этапы построения компьютерной модели, аппроксимирующей поведение сложной системы, а также затрагиваются вопросы программной реализации в части объ- ектного состава и информационного обмена между программными объектами. Отдельно решена проблема хранения программной реализации модели в виде структурированного XML-файла.