В статье рассматривается вопрос формирования системы взаимоотношений меду государственной экономической политикой и направлений развития инновационных систем. За основу принимается тезис о необходимости государственного стимулирования развития инновационных систем и экономической политики. Приводятся данные SWOT анализа по факторам развития инновационных систем Украины. Выделены основные факторы, сдерживающие рост инновационной системы. Даны рекомендации по повышению эффективности реализации национальной инновационной политики.