18632

Автор(ы): 

Автор(ов): 

4

Параметры публикации

Тип публикации: 

Статья в журнале/сборнике

Название: 

Специфичность контактов в комплексах белок-ДНК.

ISBN/ISSN: 

ISSN 2076-7633

Наименование источника: 

  • Компьютерные исследования и моделирование

Обозначение и номер тома: 

Том 1, № 3

Город: 

  • Ижевск

Издательство: 

  • АНО Ижевский институт компьютерных исследований

Год издания: 

2009

Страницы: 

281-286
Аннотация
С помощью разбиения Вороного–Делоне определены контакты между белками и нуклеи- новыми кислотами в комплексах белок-ДНК. Показано, что приблизительно треть всех контактов составляют контакты с положительно заряженными аминокислотами Arg и Lys, 32,3 %. Ser и Thr дают в сумме следующий по величине вклад — 15 %. Asn образует 6 % контактов, также как и Gly. Вклад каждой из остальных аминокислот не превышает 5 %. Установлено, что статистически значимыми являются контакты типа Asp-G, Trp-C, Glu-C, Asp-C и His-T. Предложен общий механизм участия отрицательно заряженных остатков в специфических взаимодействиях белок-ДНК. Ключевые слова: разбиение Вороного–Делоне, комплексы белок-ДНК

Библиографическая ссылка: 

Анашкина А.А., Есипова Н.Г., Кузнецов Е.Н., Туманян В.Г. Специфичность контактов в комплексах белок-ДНК. / Компьютерные исследования и моделирование. Ижевск: АНО Ижевский институт компьютерных исследований, 2009. Том 1, № 3. С. 281-286.