В статье приведены алгоритмы калибровки бортовой низкочастотной электромагнитной системы относительного позиционирования, позволяющие повысить точность определения параметров взаимного расположения источника и приемника переменного магнитного поля. Рассматриваются различные варианты постановки задачи, отличающиеся набором используемой для калибровки информации. Приводятся результаты калибровки электромагнитной системы относительного позиционирования, интегрированной в комплекс EM-4H, решающий задачу аэрогеофизических исследований с использованием летательного аппарата в качестве носителя.