Предложена методика сравнительного анализа крупномасштабных социально-экономических объектов, каждый из которых описывается большим набором показателей. Методика базируется на алгоритмах классификационного анализа сложноорганизованных данных, в том числе для структуризации набора исходных параметров используются алгоритмы экстремальной группировки, а для структуризации множества исследуемых объектов - алгоритмы автоматической классификации (кластерного анализа). Приведены результаты применения методики к задаче исследования динамики социально-экономического развития субъектов Российской Федерации.