Для исследования вопросов об оптимальном управленческом воздействии на региональную социально-экономическую систему с целью устранения структурных диспропорций в ее развитии в данной работе предлагается использовать графодинамический подход, который позволяет построить имитационную модель функционирования регионального нефтегазового кластера через описание процессов передачи различных нематериальных ресурсов предприятия при реализации хозяйственных и партнерских связей, а также через формальное представление зависимостей между состоянием системы в каждый текущий и последующий моменты времени.