Лаборатория была создана в конце 1993 г. решением Учёного совета Института. Заведующим новой лабораторией был избран кандидат технических наук Евгений Владимирович Юркевич, возглавляющий её и в настоящее время (ныне д.т.н., профессор, академик РАЕН).

С момента основания лаборатории в ней трудятся к.т.н. Л.Г Дмитренко, к.т.н. Г. Г. Воробьёв и Л. Н. Крюкова, несколько позже в лабораторию влились д.юр.н., профессор Б. В. Колосов, д.т.н., профессор Ю. В. Сидельников, м.н.с. С. А. Салтыков, м.н.с. А. А. Санжара и инж. Н. К. Буртный.

Лаборатория образована как научное подразделение, развивающее идеи построения Государственной системы приборов и средств автоматизации нового поколения (ГСП-2). Этим объясняется тесный контакт её тематики 90-х годов с заказами Российского комитета по машиностроению (преемника Минприбора), Госстандарта России, Российского комитета по информатизации. Первыми результатами, полученными в лаборатории, были модели оперативных воздействий, определяющие пути совершенствования работы этих органов государственного управления в новых рыночных условиях.

Более десяти лет на базе лаборатории активно работал Орган по сертификации электрооборудования, аккредитованный Госстандартом России, а сотрудники лаборатории были аккредитованы как эксперты в области информационных технологий и электротехники. Среди заявителей этого Органа были IBM, DUX, Samsung и другие крупные корпорации.

Выбор современного направления исследований был предопределён необходимостью повышения надёжности управления автоматизированными системами. В международных стандартах используется понятие функциональной безопасности программно-технических средств. Использование подобного понятия в организационно-экономических системах привело к необходимости введения термина «функциональная надёжность».

В настоящее время специалистами лаборатории изучается возможность обеспечения функциональной надёжности инжиниринга, как технологии управления инновациями в технике, природе, экономике, образовании. Спецификой предлагаемых подходов является ориентация на анализ и устранение причин нерегулярности получения ожидаемых результатов оперативных воздействий. Таким образом, в центре научных интересов лаб. № 13 оказалось изучение влияния информации, передаваемой между элементами рассматриваемых систем, на действие известных законов и закономерностей. Для решения такой проблемы предложена методология, позволяющая определить требования к функции безопасности (что такая функция делает) и полноте безопасности (вероятности того, что функция безопасности выполняется удовлетворительно). Сегодня этот подход с успехом используется приборостроительными заводами.

В лаборатории изучаются возможности построения автоматизированных систем верификации и валидации программно-технических комплексов, а также компьютерных средств поддержки информационно-аналитической деятельности. Разработанная система оценки трудоёмкости реализации ИТ проектов принята в одном коммерческом банке.

Для обеспечения функциональной надёжности управления в организационно-экономических системах и образовании предложена и используется методология социального реинжиниринга, позволяющая минимизировать затраты на обеспечение качества продукции и услуг с помощью кардинальной реорганизации отношений между специалистами. При этом образование рассматривается как производство средств производства интеллектуального продукта. В этой связи для оптимизации межличностного общения предложена оригинальная оценка уровня культуры коммуникаций как характеристика глубины обратной связи, обеспечивающей функциональную надёжность ожидаемых результатов информационного воздействия.

В соответствии с положениями международных стандартов по функциональной безопасности рассматриваются особенности правовых ограничений в обеспечении функциональной надёжности управления в слабоструктурированных системах. Полученные результаты приняты в Фонде по реформированию жилищно-коммунального хозяйства, а также в Государственных корпорациях «Ростехнология» и «Роснанотех». Впервые правовой анализ понятия «интерес субъекта правоотношений» позволил использовать его в качестве критерия функциональной надёжности применения российских и международных правовых норм.

Для формирования общего подхода к обеспечению функциональной безопасности работы объектов различной природы рассматривается физика процессов управления. В этом направлении ведутся работы по построению унитарной модели организации материи на её нижних уровнях. Предложена модель внешней среды для процессов управления аналогичных естественно-природным. На основании выявленных несоответствий между свойствами формального нейрона и свойствами физиологического нейрона предложена модель «онтонейрона» в виде дискретного узла решающего поля, позволяющая создавать механизм идентификации этапов технологических процессов.

Важным направлением работ лаборатории является экспертное прогнозирование. Предложен подход, позволяющий, используя прогноз результатов работы рассматриваемых систем, осуществлять контроль их функциональной надёжности. Разработанные оригинальные алгоритмы установления соответствия между сложностью реализации стратегии, выбранной компанией, и методами экспертного прогноза позволили повысить точность такого контроля. Полученные результаты используются Международной академией исследования будущего (вице-президент д.т.н., профессор Ю. В. Сидельников) и Федеральным агентством по делам молодёжи.

Для создания необходимых условий полноценного творчества и раскрытия научного потенциала начинающих учёных создан Инновационный центр при Московском авиационном институте и ИПУ РАН. Руководителем этого центра является г.н.с. лаборатории № 13, д.т.н., профессор Ю. В. Сидельников, а сотрудниками — м.н.с. С. А. Салтыков и м.н.с. А. А. Санжара. Центр оказывает помощь в доработке смелых идей студентов, привлекая их к участию в конференциях, содействуя публикациям работ студентов в журналах и сборниках.

Лаборатория является одним из организаторов конференций «Функциональная безопасность. (Нормы, практика и тенденции развития систем контроля и управления. Их роль в обеспечении безопасности)», «Ноосферное образование», международной конференции «Информационные технологии в науке, социологии, экономике и бизнесе», регулярно участвует в международных конференциях «Проблемы управления», «Системные проблемы надёжности, математического моделирования и информационных технологий», «Управление развитием крупномасштабных систем», «Гагаринские чтения», неоднократно участвовала в инвестиционных салонах и выставках ВВЦ, проводимых Международным союзом промышленником и предпринимателей, и др.

Результаты работ лаборатории опубликованы в 14 монографиях, 8 учебных пособиях, нескольких программах учебных курсов для вузов, 4 брошюрах и более чем двухстах статьях. К 10-летнему юбилею лаборатории издан специальный выпуск Трудов Института (том XXII), содержащий статьи только сотрудников лаб. № 13. Журнал «Надёжность» (главный редактор — д.т.н., профессор Е. В. Юркевич, зам главного редактора Л. Н. Крюкова), где регулярно публикуются работы сотрудников Института, включён в список изданий, статьи в которых засчитываются ВАК России при защите диссертаций.